K-Means聚类算法

聚类(Clustering)是数据挖掘和机器学习中的一种重要技术,用于将数据集中的样本划分为多个相似的组或类别。这种方法在许多领域得到了广泛应用,例如:

聚类是一种无监督学习,因为它不需要预先定义的标签,只是根据数据特征去学习,通过度量特征相似度或者距离,然后把已知的数据集划分成若干个不同的类别。与分类不同,聚类任务的目标是发现数据内在的结构。聚类算法大体上可以分为:基于距离的聚类基于密度的聚类层次聚类谱聚类等。如果你还分不清楚聚类和分类到底有什么区别,相信下面的图可以帮到你。

算法原理

下面我们重点为大家介绍名为 K-Means 的聚类算法。K-Means 是一种基于原型的分区聚类方法,其目标是将数据集划分为K个簇,并使每个簇内的数据点尽可能相似。K-Means 算法的实施步骤如下所示:

  1. 初始化簇中心:随机选择K个样本作为初始簇中心,簇中心通常也称为质心。
  2. 分配样本到最近的质心:计算每个样本与所有质心的距离,将样本分配到最近的簇。
  3. 更新质心:计算每个簇的所有样本的均值,并将其作为新的质心。
  4. 重复步骤2和步骤3,直到质心收敛或达到预设的迭代次数。

数学描述

我们将上面的算法原理用数学语言进行描述。对于给定的数据集 ,K-Means 算法的目标是最小化目标函数(总误差平方和)。目标函数如下所示:

$$ J = \sum_{i=1}^{K} \sum_{x \in C_{i}} {\lVert x - \mu_{i} \rVert}^{2} $$

其中, $\small{K}$ 是簇的数量, $\small{C_{i}}$ 表示第 $\small{i}$ 个簇中的样本集合, $\small{\mu_{i}}$ 是第 $\small{i}$ 个簇的中心, $\small{x}$ 是数据点。因为这个问题属于 NP 困难组合优化问题,所以在实际求解时我们会采用迭代的方式来寻求满意解。

首先随机选择 $\small{K}$ 个点作为初始质心 $\small{\mu_{1}, \mu_{2}, \cdots, \mu_{K}}$ ,对于每个数据点 $\small{x_{j}}$ ,计算到每个质心的距离,选择距离最近的质心,即:

$$ C_{i} = \lbrace {x_{j} \ \vert \ {\lVert x_{j} - \mu_{i} \rVert}^{2} \le {\lVert x_{j} - \mu_{k} \rVert}^{2} \ \text{for all} \ k \ne i} \rbrace $$

更新质心为簇中所有点的均值,即:

$$ \mu_{i} = \frac{1}{\lvert C_{i} \rvert}\sum_{x \in C_{i}} x $$

重复上面两个动作,直到质心不再变化或变化小于某个阈值,这就确保了算法的收敛性。

代码实现

下面我们用 Python 代码实现 K-Means 聚类,我们先暂时不使用 scikit-learn 库,主要帮助大家理解算法的工作原理。

```python import numpy as np

def distance(u, v, p=2): """计算两个向量的距离""" return np.sum(np.abs(u - v) ** p) ** (1 / p)

def init_centroids(X, k): """随机选择k个质心""" index = np.random.choice(np.arange(len(X)), k, replace=False) return X[index]

def closest_centroid(sample, centroids): """找到跟样本最近的质心""" distances = [distance(sample, centroid) for i, centroid in enumerate(centroids)] return np.argmin(distances)

def build_clusters(X, centroids): """根据质心将数据分成簇""" clusters = [[] for _ in range(len(centroids))] for i, sample in enumerate(X): centroid_index = closest_centroid(sample, centroids) clusters[centroid_index].append(i) return clusters

def update_centroids(X, clusters): """更新质心的位置""" return np.array([np.mean(X[cluster], axis=0) for cluster in clusters])

def make_label(X, clusters): """生成标签""" labels = np.zeros(len(X)) for i, cluster in enumerate(clusters): for j in cluster: labels[j] = i return labels

def kmeans(X, *, k, max_iter=1000, tol=1e-4): """KMeans聚类""" # 随机选择k个质心 centroids = init_centroids(X, k) # 通过不断的迭代对数据进行划分 for _ in range(max_iter): # 通过质心将数据划分到不同的簇 clusters = build_clusters(X, centroids) # 重新计算新的质心的位置 new_centroids = update_centroids(X, clusters) # 如果质心几乎没有变化就提前终止迭代 if np.allclose(new_centroids, centroids, rtol=tol): break # 记录新的质心的位置 centroids = new_centroids # 给数据生成标签 return make_label(X, clusters), centroids ```

我们仍然以鸢尾花数据集为例,看看我们自己实现的kmeans函数能否为将三种鸢尾花划分为三个不同的类别。由于是无监督学习,这里我们直接把整个数据集带入kmeans函数,代码如下所示。

```python from sklearn.datasets import load_iris

iris = load_iris() X, y = iris.data, iris.target labels, centers = kmeans(X, k=3) ```

这里,千万不要直接拿y_predy进行比较,我们之前说过,聚类算法并不知道数据对应的标签,它只是根据特征将数据划分为不同的类别,这里输出的012 并不直接对应到山鸢尾、多彩鸢尾和为吉尼亚鸢尾。我们可以用可视化的方式来看看预测的结果,代码如下所示:

```python import matplotlib.pyplot as plt

colors = ['#FF6969', '#050C9C', '#365E32'] markers = ['o', 'x', '^']

plt.figure(dpi=200) for i in range(len(centers)): samples = X[labels == i] print(markers[i]) plt.scatter(samples[:, 2], samples[:, 3], marker=markers[i], color=colors[i]) plt.scatter(centers[i, 2], centers[i, 3], marker='*', color='r', s=120)

plt.xlabel('Petal length') plt.ylabel('Petal width') plt.show() ```

输出:

我们用原始数据重新输出,跟上面的图做一个对比,代码如下所示。

```python import matplotlib.pyplot as plt

colors = ['#FF6969', '#050C9C', '#365E32'] markers = ['o', 'x', '^']

plt.figure(dpi=200) for i in range(len(centers)): samples = X[y == i] plt.scatter(samples[:, 2], samples[:, 3], marker=markers[i], color=colors[i])

plt.xlabel('Petal length') plt.ylabel('Petal width') plt.show() ```

输出:

直接使用 scikit-learn 库cluster模块的KMeans类实现 K-Means 聚类是更好的选择,代码如下所示。

```python from sklearn.cluster import KMeans

创建KMeans对象

km_cluster = KMeans( n_clusters=3, # k值(簇的数量) max_iter=30, # 最大迭代次数 n_init=10, # 初始质心选择尝试次数 init='k-means++', # 初始质心选择算法 algorithm='elkan', # 是否使用三角不等式优化 tol=1e-4, # 质心变化容忍度 random_state=3 # 随机数种子 )

训练模型

km_cluster.fit(X) print(km_cluster.labels_) # 分簇的标签 print(km_cluster.cluster_centers_) # 各个质心的位置 print(km_cluster.inertia_) # 样本到质心的距离平方和 ```

下面我们对KMeans类的几个超参数加以说明:

  1. n_clusters:指定聚类的簇数,即 $\small{K}$ 值,默认值为8
  2. max_iter:最大迭代次数,默认值为300,控制每次初始化中 K-Means 迭代的最大步数。
  3. init:初始化质心的方法,默认值为'k-means++',表示从数据中多次随机选取 K 个质心,每次都计算这一次选中的中心点之间的距离,然后取距离最大的一组作为初始化中心点,推荐大家使用这个值;如果设置为'random'则随机选择初始质心。
  4. n_init:和上面的参数配合,指定算法运行的初始化次数,默认值为10
  5. algorithm:K-Means 的计算算法,默认值为'lloyd'。还有一个可选的值为'elkan',表示基于三角不等式的优化算法,适用于 K 值较大的情况,计算效率较高。
  6. tol:容忍度,控制算法的收敛精度,默认值为1e-4。如果数据集较大时,可适当增大此值以加快收敛速度。

总结

K-Means 是一种经典的聚类算法,它的优点包括实现简单,算法收敛速度快;缺点是结果不稳定(跟初始值设定有关系),无法解决样本不均衡的问题,容易收敛到局部最优解,受噪声数据影响较大。如果你想通过可视化的方式理解聚类的过程,我们给大家推荐一个名为 Naftali 的人的博客,该网站上提供了可视化的方式展示 K-Means 和 DBSCAN 聚类(一种基于密度的聚类算法),如下图所示。